ชีววิทยาของพืช · ระดับ 3

คุณเปลี่ยนกลิ่นของสายพันธุ์ได้ไหม?

2.5b · 9 นาทีในการอ่าน

⚙ บทเรียนนี้แปลด้วยเครื่องและกำลังรอการตรวจทานโดยคน

สิ่งที่คุณต้องรู้

ไม่ได้ — คุณเปลี่ยนกลิ่นของสายพันธุ์ไม่ได้ ได้แค่ว่าคุณจะเก็บมันไว้มากแค่ไหน โปรไฟล์ terpene ของคุณถูกเข้ารหัสทางพันธุกรรม: ทีมของ Allen ทำแผนที่ตระกูลยีน terpene synthase ทั้งหมด (55 ยีน) ข้าม 240 cultivar และพบว่าสูตรถูกกำหนดด้วยว่ายีน TPS ตัวไหนแสดงออกและหนักแค่ไหน สภาพแวดล้อมและการตากแห้ง/cure แบบเบาและช้าตัดสินว่าจะเหลือรอดถึงโหลแค่ไหน ไม่ใช่ว่าต้นสร้าง terpene ตัวไหน

กลิ่นของสายพันธุ์คุณถูกกำหนดด้วยว่ามันแสดงออกยีน terpene synthase ตัวไหนและในระดับเท่าไร ทีมของ Allen ที่ Steep Hill Labs ทำแผนที่ตระกูลยีน terpene synthase ทั้งหมด — 55 ยีนรวม — และทำโปรไฟล์ terpene ข้าม 240 cultivar ข้อสรุปตรงไปตรงมา: คุณกระตุ้นผลได้ terpene ด้วยสภาพแวดล้อมได้ แต่คุณเขียนสูตร terpene ใหม่ไม่ได้ The Cheese จะกลิ่นเหมือนชีส The Haze จะกลิ่นเหมือนเฮซ นั่นไม่ใช่ข้อจำกัด — นั่นคือรากฐานของการคัดเลือกพันธุกรรมที่เชื่อถือได้

การเข้าใจว่า terpene ถูกกำหนดทางพันธุกรรม ไม่ใช่ถูกปรับเปลี่ยนด้วยสภาพแวดล้อม ช่วยให้คุณตัดสินใจเรื่องการผสมพันธุ์ได้ฉลาดขึ้น เลือก cultivar ได้แม่นยำขึ้น และเลิกเสียเวลากับการปรับสภาพแวดล้อมที่ไม่เปลี่ยนโปรไฟล์

วิทยาศาสตร์

การศึกษาของ Allen มีสองส่วน อย่างแรก พวกเขาทำโปรไฟล์ปริมาณ terpene ข้าม 240 cultivar กัญชาด้วยการวิเคราะห์ GC-MS ของตัวอย่างดอกที่จะส่งไป dispensary ในรัฐวอชิงตัน อย่างที่สอง พวกเขาใช้การประกอบจีโนม Jamaican Lion ที่เพิ่งมีให้ใช้ เพื่อระบุและจำแนกยีน terpene synthase (TPS) ทั้งหมด — เอนไซม์ที่สร้าง terpene จากโมเลกุลตั้งต้นจริงๆ

ความหลากหลายของ terpene ข้าม cultivar: ตัวอย่างดอกโดยเฉลี่ยมี terpene ที่ตรวจพบได้ 11.2 ตัวที่เกิน 1% ของปริมาณ terpene ทั้งหมด โดยมี 5.4 ตัวที่เกิน 5% terpene ที่เด่นสุด (มักเป็น myrcene, caryophyllene, limonene หรือ terpinolene) เฉลี่ยแค่ 35% ของทั้งหมด terpene สี่ตัวบนสุดคิดเป็น 72% ของปริมาณรวม นี่หมายความว่าโปรไฟล์ terpene ซับซ้อน — ไม่เคยมีแค่ “terpene ตัวเดียว” ที่นิยามสายพันธุ์ ถึงแม้การตลาดจะบอกตรงข้าม

คู่ terpene ที่สัมพันธ์กัน: นี่คือข้อค้นพบที่เผยการควบคุมในระดับเอนไซม์ β-caryophyllene และ α-humulene แสดงค่า R² ที่ 0.92 — สัมพันธ์กันเกือบสมบูรณ์แบบ นั่นเพราะ TPS9 เอนไซม์ตัวเดียว ผลิตทั้งสองสารในอัตราส่วนราว 3:1 D-limonene และ camphene: R² = 0.92 α-terpineol และ fenchol: R² = 0.85 เมื่อ terpene สองตัวสัมพันธ์กันแน่นข้าม cultivar หลายร้อยตัว มันหมายความว่ามันมาจากเอนไซม์เดียวกัน คุณเพิ่มตัวหนึ่งโดยไม่เพิ่มอีกตัวไม่ได้ และคุณเปลี่ยนอัตราส่วนไม่ได้เพราะอัตราส่วนถูกสร้างเข้าไปในตำแหน่งกัมมันต์ (active site) ของเอนไซม์

ตระกูลยีน: Allen ระบุยีน TPS แบบเต็มความยาว 55 ยีนในจีโนมกัญชา จำแนกเป็นสามตระกูลย่อย: TPS-a (sesquiterpene synthase 21 ตัว), TPS-b (monoterpene synthase 26 ตัว) และ TPS-c (diterpene synthase 4 ตัว) มีแค่ 12 ตัวที่ถูกจำแนกเชิงหน้าที่ก่อนการศึกษานี้ ข้อมูลการแสดงออก RNA จาก Purple Kush แสดงว่ามีแค่สามยีน (TPS1, TPS18, TPS5) ที่ครองการแสดงออก TPS ทั้งหมด โดย TPS1 (limonene synthase) เป็นตัวที่แสดงออกมากที่สุดโดยรวม

เอนไซม์หลายผลิตภัณฑ์: เอนไซม์ TPS ของกัญชาส่วนใหญ่ผลิต terpene หลายผลิตภัณฑ์จากสารตั้งต้นตัวเดียว TPS5 ผลิต β-myrcene เป็นผลิตภัณฑ์หลักแต่ก็สร้าง α-pinene ด้วย TPS33 ผลิตทั้ง α-terpinene และ γ-terpinene ในปริมาณราวๆ เท่ากัน ธรรมชาติหลายผลิตภัณฑ์นี้คือเหตุที่โปรไฟล์ terpene ซับซ้อน — ยีนที่แสดงออกสูงจำนวนน้อยผลิตชุดสารที่ซ้อนทับกัน และโปรไฟล์รวมเกิดจากผลลัพธ์ที่รวมกัน

ยีน TPS เฉพาะราก: ทีมของ Allen ค้นพบคลัสเตอร์ของยีน TPS สี่ตัวที่เกือบเหมือนกันซึ่งแสดงออกเฉพาะในราก ไม่ใช่ดอก monoterpene synthase ของรากเหล่านี้มีผลิตภัณฑ์ที่ยังไม่รู้ แต่อาจมีบทบาทในปฏิสัมพันธ์เชิงนิเวศใต้ดิน ข้อค้นพบนี้หมายความว่าต้นสร้าง terpene ที่คุณไม่เคยดม ในเนื้อเยื่อที่คุณไม่เคยเก็บเกี่ยว เพื่อวัตถุประสงค์ที่ไม่เกี่ยวกับโหลของคุณเลย

จากยีน terpene synthase สู่กลิ่นของสายพันธุ์ ต้นกัญชาพกยีน terpene synthase (TPS) อยู่ราว 55 ยีน แต่มีเพียงบางชุดที่เปิดใช้งานในแต่ละต้น ยีนที่จุดทำงานเป็นตัวกำหนดว่าเทอร์ปีนตัวไหนจะถูกสร้าง และเทอร์ปีนเหล่านั้นก็กำหนดกลิ่น ฟีโนไทป์สองตัวจากซองเมล็ดเดียวกันอาจแสดงออกยีนต่างกันและจึงมีกลิ่นต่างกันอย่างสิ้นเชิง คุณเลือกได้ว่าจะส่งต่อยีนตัวไหน แต่คุณบังคับให้ต้นไม้สร้างเทอร์ปีนที่มันไม่มียีนสำหรับมันไม่ได้ ทำไมต้นสองต้นจากซองเดียวถึงมีกลิ่นต่างกัน กลิ่นคือลายนิ้วมือการแสดงออกของยีน — ยีนเทอร์ปีนตัวไหนจุดทำงาน ไม่ใช่ดินหรือพระจันทร์ ยีน TPS 55 ยีน บางชุดเปิดใช้งาน ■ แสดงออก ฟีโนต่างกัน = ชุดต่างกัน เทอร์ปีนที่สร้างขึ้น Myrcene Limonene Pinene Linalool ชุดที่จุดทำงาน กลิ่น กลิ่นดินกลิ่นส้มกลิ่นสนกลิ่นดอกไม้ ลายนิ้วมือกลิ่น เลือกตามกลิ่น ก็เท่ากับคุณเลือกว่าจะส่งต่อยีนตัวไหน แต่คุณบรรจุเทอร์ปีนที่ต้นไม้ไม่มียีนจะสร้างไม่ได้
ตระกูลยีน terpene synthase Cannabis มียีน terpene synthase ราว 55 ยีน แบ่งเป็นสามตระกูลย่อย: TPS-b มี 26 ยีนสำหรับ monoterpenes, TPS-a มี 21 ยีนสำหรับ sesquiterpenes และ TPS-c มี 4 ยีนสำหรับ diterpenes ถึงอย่างนั้น ต้นหนึ่งมักแสดงออก terpenes ราว 11 ตัวที่เกินหนึ่งเปอร์เซ็นต์ และสี่ตัวบนสุดรวมกันราว 72 เปอร์เซ็นต์ของโปรไฟล์ ยีน terpene ราว 55 ยีน สามตระกูล จำนวนยีนมาก — แต่มี terpenes แค่ไม่กี่ตัวที่ครองได้ 26 TPS-b monoterpenes 21 TPS-a sesquiterpenes 4 TPS-c diterpenes ยีนในตระกูล แต่ในทางปฏิบัติ ~11 terpenes ที่เกิน 1% 72% จากสี่ตัวบนสุดเพียว ๆ ต้นหนึ่งสร้าง terpene ได้เฉพาะตัวที่มี ยีน สำหรับมัน — แต่ยีนตัวไหนทำงานเป็นตัวกำหนดกลิ่น
Limonene — skeletal structure (C₁₀H₁₆), a monoterpene; aroma: bright citrus Limonene C₁₀H₁₆ monoterpene · bright citrus Camphene — skeletal structure (C₁₀H₁₆), a monoterpene; aroma: pungent, fir Camphene C₁₀H₁₆ monoterpene · pungent, fir Myrcene — skeletal structure (C₁₀H₁₆), a monoterpene; aroma: earthy, herbal, clove Myrcene C₁₀H₁₆ monoterpene · earthy, herbal, clove α-Pinene — skeletal structure (C₁₀H₁₆), a monoterpene; aroma: fresh pine α-Pinene C₁₀H₁₆ monoterpene · fresh pine β-Caryophyllene — skeletal structure (C₁₅H₂₄), a sesquiterpene; aroma: pepper, spice β-Caryophyllene C₁₅H₂₄ sesquiterpene · pepper, spice Humulene — skeletal structure (C₁₅H₂₄), a sesquiterpene; aroma: woody, hoppy Humulene C₁₅H₂₄ sesquiterpene · woody, hoppy α-Terpineol — skeletal structure (C₁₀H₁₈O), a monoterpenoid; aroma: lilac, pine α-Terpineol C₁₀H₁₈O monoterpenoid · lilac, pine Fenchol — skeletal structure (C₁₀H₁₈O), a monoterpenoid; aroma: camphor, lime Fenchol C₁₀H₁₈O monoterpenoid · camphor, lime β-Ocimene — skeletal structure (C₁₀H₁₆), a monoterpene; aroma: sweet, herbal β-Ocimene C₁₀H₁₆ monoterpene · sweet, herbal Terpinolene — skeletal structure (C₁₀H₁₆), a monoterpene; aroma: fresh, herbal, woody Terpinolene C₁₀H₁₆ monoterpene · fresh, herbal, woody

วิธีนำไปปฏิบัติ

  • เลือกพันธุกรรมของคุณตามโปรไฟล์ terpene ไม่ใช่ตามวิธีปลูก ถ้าคุณอยากได้ดอกที่ limonene เด่น ปลูก cultivar ที่แสดงออก TPS1 สูง ถ้าคุณอยากได้ myrcene หาพันธุกรรมที่แสดงออก TPS5 หนักๆ ไม่มีปริมาณกากน้ำตาล แสง UV หรือการบงการอุณหภูมิเท่าไรที่จะแปลงสายพันธุ์ myrcene เด่นให้เป็น limonene เด่นได้

  • เลิกเชื่อป้าย “indica vs sativa” สำหรับความคาดหวังเรื่อง terpene ข้อมูลของ Allen แสดงว่าโปรไฟล์ terpene จับกลุ่มตาม cultivar ไม่ใช่ตามการแบ่ง indica/sativa สายพันธุ์ “sativa” สองตัวมีโปรไฟล์ terpene ต่างกันโดยสิ้นเชิงได้ และตัวที่ติดป้าย “indica” มีโปรไฟล์เดียวกับตัวที่ติดป้าย “sativa” ได้ ชื่อคือการตลาด ไม่ใช่เคมี

  • โฟกัสที่สิ่งที่คุณควบคุมได้: จังหวะเก็บเกี่ยวและสภาวะการตากแห้ง/curingมีผลต่อว่า terpene ตัวไหนถูกรักษาไว้ในผลผลิตสุดท้าย แม้ว่ามันจะเปลี่ยนไม่ได้ว่าต้นสร้าง terpene ตัวไหน Monoterpene (myrcene, limonene, pinene) ระเหยง่ายและระเหยไประหว่างการตากแห้งที่รุนแรง การตากแห้งแบบเบาและช้ารักษาโปรไฟล์ที่พันธุกรรมสร้างไว้ได้มากกว่า

  • ถ้าคุณกำลังคัดเลือกเมล็ดหรือ clone ขอผลตรวจ terpene จากผู้ผสมพันธุ์ ไม่ใช่แค่เปอร์เซ็นต์ THC ข้อมูล terpene บอกคุณได้มากกว่าว่าดอกจะกลิ่นและรสจริงเป็นอย่างไร มากกว่าชื่อสายพันธุ์หรือคำบรรยายการตลาดใดๆ

Seb’s Corner (Level 2+)

การจัดระเบียบเชิงจีโนมของตระกูล TPS เผยให้เห็นอะไรหลายอย่าง ราวครึ่งหนึ่งของยีนอยู่ในแถวจีโนม (genomic array) — คลัสเตอร์ของยีนที่เกี่ยวข้องใกล้ชิดบนโครโมโซมเดียวกัน บ่งชี้เหตุการณ์การทำซ้ำยีน (gene duplication) ที่เพิ่งเกิด คลัสเตอร์ใหญ่ที่สุดมียีน TPS-b 11 ตัวกินพื้นที่ราวหนึ่งเมกะเบส รวมถึง synthase ของ limonene (TPS1), α-pinene (TPS2), β-myrcene (TPS3) และ β-ocimene (TPS13) ที่ถูกจำแนกแล้ว ยีนเหล่านี้มีความเหมือนกันของกรดอะมิโนเฉลี่ย 66% บ่งชี้ว่ามันแยกตัวจากบรรพบุรุษร่วมแต่อยู่ภายใต้การคัดเลือกที่ต่างกันเพื่อความจำเพาะของผลิตภัณฑ์ คลัสเตอร์ TPS5/TPS11 น่าสนใจเป็นพิเศษ: TPS5 (myrcene synthase ตัวเด่น) มีความเหมือน 73% กับ synthase เฉพาะรากสี่ตัว (TPS11, TPS36, TPS37, TPS38) ทั้งที่มีรูปแบบการแสดงออกต่างกันโดยสิ้นเชิงและน่าจะมีผลิตภัณฑ์ต่างกัน นี่บ่งชี้ว่าวิวัฒนาการของโปรโมเตอร์เฉพาะเนื้อเยื่อ ไม่ใช่แค่วิวัฒนาการของลำดับโค้ด เป็นตัวขับสำคัญของการกระจายความหลากหลายของโปรไฟล์ terpene สำหรับผู้ผสมพันธุ์ นัยสำคัญคือการปรับเปลี่ยนโปรไฟล์ terpene ต้องอาศัยการเปลี่ยนแปลงในระดับการกำกับ (ยีนตัวไหนถูกเปิด ที่ไหน และเมื่อไร) พอๆ กับในระดับโปรตีน (เอนไซม์แต่ละตัวผลิตอะไร) สิ่งนี้ทำให้การผสมพันธุ์ terpene ซับซ้อนกว่าการผสมพันธุ์ chemotype ของcannabinoid ซึ่ง locus ทางพันธุกรรมตัวเดียวควบคุมอัตราส่วน THC:CBD

สิ่งที่ต้องระวัง

  • ธาตุอาหาร “เร่ง terpene”: สารตั้งต้น terpene (GPP สำหรับ monoterpene, FPP สำหรับ sesquiterpene) ถูกสังเคราะห์จากสารกลางของเมตาบอลิซึมปฐมภูมิ — pyruvate, glyceraldehyde-3-phosphate และ acetyl-CoA สิ่งเหล่านี้มีอยู่อย่างเหลือเฟือในต้นที่สุขภาพดี กินอิ่มทุกต้น ไม่มีหลักฐานว่าอาหารเสริมธาตุอาหารเฉพาะตัวเพิ่มการป้อนสารตั้งต้น terpene เกินกว่าที่โภชนาการปกติให้ ถ้าสินค้าอ้างว่า “เร่ง terpene” ขอการทดลองที่ผ่าน peer-review มันไม่มีอยู่

  • มายาคติการปรับ terpene ด้วยสภาพแวดล้อม: อุณหภูมิที่ตกลง แสง UV เทคนิคความเครียด — ไม่มีตัวไหนเปลี่ยนโปรไฟล์ terpene ที่พันธุกรรมกำหนดไว้ มันอาจกระตุ้นความเข้มข้น terpene รวมขึ้นเล็กน้อย (ระดับเสียง) แต่ไม่เปลี่ยนอัตราส่วน (EQ)

  • Pheno-hunt เป็นรูเล็ตทางพันธุกรรม: ถ้าคุณปลูกจากเมล็ด (ไม่ใช่ clone) phenotype สองตัวจากการผสมเดียวกันแสดงออกชุดยีน TPS ต่างกันได้เพราะการแยกตัวทางพันธุกรรม (segregation) การผันแปรนั้นเป็นพันธุกรรม ไม่ใช่สภาพแวดล้อม พอคุณเจอ pheno ที่ต้องการแล้ว clone มันเพื่อรักษาไว้

  • ความไม่น่าเชื่อถือของชื่อสายพันธุ์: “OG Kush” สองตัวจากแหล่งต่างกันมีโปรไฟล์ terpene ต่างกันโดยสิ้นเชิงได้ ชื่อคือการตลาด ผลตรวจคือเคมี

Quiz

1. β-caryophyllene และ α-humulene สัมพันธ์กันที่ R² = 0.92 ข้าม cultivar นั่นบอกอะไรเรา

2. Allen ระบุยีน terpene synthase (TPS) แบบเต็มความยาวกี่ยีนในจีโนมกัญชา

3. (ถูก/ผิด) คุณเปลี่ยนสายพันธุ์ myrcene เด่นให้เป็น limonene เด่นได้ด้วยคืนที่เย็นกว่าและแสง UV

4. เอนไซม์ terpene synthase ของกัญชาส่วนใหญ่ผลิต:

5. เปรียบเทียบรายการ seed-bank สองรายการสำหรับชื่อสายพันธุ์เดียวกัน ทำไมถึงเชื่อข้อมูลตรวจ terpene มากกว่าชื่อ